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第八期生物數(shù)據(jù)分析技能實(shí)訓(xùn)會(huì)
訪問(wèn)量:2143次  |  發(fā)布時(shí)間:2018-05-25 15:34

第八期生物數(shù)據(jù)分析技能實(shí)訓(xùn)會(huì)

隨著高通量組學(xué)技術(shù)的蓬勃發(fā)展,生物醫(yī)學(xué)正加速進(jìn)入大數(shù)據(jù)時(shí)代。借助生物醫(yī)學(xué)多組學(xué)、多層次的海量數(shù)據(jù),可以從前所未有的廣度和深度來(lái)研究生物體運(yùn)行機(jī)制,但海量復(fù)雜數(shù)據(jù)帶來(lái)的挑戰(zhàn)同樣巨大。由于生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)多呈分散復(fù)雜特征,因此常需要深入分析已有數(shù)據(jù)。在此基礎(chǔ)上,以海量數(shù)據(jù)發(fā)掘與解析為主體內(nèi)容的生物信息學(xué)技能就成為科研必要手段,如疾病的病因?qū)W、臨床診斷標(biāo)志物、作用靶點(diǎn)識(shí)別,關(guān)鍵大分子的發(fā)現(xiàn)與功能預(yù)測(cè),以及遺傳調(diào)控機(jī)制等方面。會(huì)議特邀倫永志教授擔(dān)任主講教師。本課程曾分別用名《基因序列分析技術(shù)》和《功能基因組信息分析技術(shù)》,后將上述兩門(mén)課程整合更名為《生物數(shù)據(jù)分析技能》。自第七期會(huì)議起,倫老師對(duì)課程內(nèi)容進(jìn)行了較大幅度更新,以順應(yīng)學(xué)科發(fā)展和學(xué)員需要。授課繼續(xù)沿用倫老師獨(dú)創(chuàng)的TPSTeaching-Practicing-Showing教學(xué)模式,著力于以實(shí)際問(wèn)題為引線,將理論授課與上機(jī)實(shí)踐有機(jī)地融為一體,逐步介紹涉及的各項(xiàng)技能,并指導(dǎo)學(xué)員將其融會(huì)貫通以真正掌握相關(guān)的基本方法與常用工具。TPS教學(xué)模式多年來(lái)在本科、研究生教學(xué)及二十余期培訓(xùn)會(huì)議中取得了極佳的教學(xué)效果,受到廣大學(xué)員的一致好評(píng)和推崇。

主辦單位:

北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司

時(shí)間地點(diǎn):

2018712日(周四)報(bào)到,713~15日授課。

南京錦江都城酒店,地址:南京雨花臺(tái)區(qū)安德門(mén)大街50號(hào)。

培訓(xùn)日程(全部課程均含上機(jī)實(shí)踐):

日期

時(shí)間

授課題目

授課內(nèi)容

712

16:00-21:00

報(bào)到(外地學(xué)員)

 

713

08:00-08:30

報(bào)到(本地學(xué)員)

 

08:30-09:00

預(yù)裝軟件.調(diào)試網(wǎng)絡(luò)

 

09:00-12:00

核酸信息注釋

NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)常用資源:NucleotideGeneUnigene子數(shù)據(jù)庫(kù)的功能及信息注釋?zhuān)怀R?jiàn)序列格式的轉(zhuǎn)換。

EBI數(shù)據(jù)庫(kù)常用資源:HGNC、Expression Atlas子數(shù)據(jù)庫(kù)的功能及信息注釋。

序列比對(duì)工具:局部比對(duì)工具BLAST;全局比對(duì)工具ClustalX;保守信息圖形化工具Weblogo。

14:00-16:00

核酸信息注釋

基因結(jié)構(gòu)注釋在線工具:內(nèi)含子剪切位點(diǎn)、可變剪接、啟動(dòng)子序列、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。

16:00-18:00

蛋白質(zhì)信息注釋

蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù):UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)的功能及信息注釋。

蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù):String數(shù)據(jù)庫(kù)的信息注釋。

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù):PDB數(shù)據(jù)庫(kù)的信息注釋。

714

09:00-12:00

非編碼RNA信息注釋及靶基因預(yù)測(cè)

miRNA信息注釋及靶基因預(yù)測(cè):miRBase/TargetScan/miRTarBase等數(shù)據(jù)庫(kù)

LncRNA信息注釋及靶基因預(yù)測(cè):NONCODE/LNCipedia/lncrnadb等數(shù)據(jù)庫(kù)

14:00-18:00

基因集功能富集分析

Gene Ontology、KEGG pathway數(shù)據(jù)庫(kù)的信息注釋

利用DAVID在線工具富集分析基因集功能

利用Excel軟件/Venn在線工具繪制基因集功能富集圖及維恩圖(Venn分析)

715

09:00-12:00

基因表達(dá)數(shù)據(jù)處理與分析

利用ArrayTools軟件處理從NCBI GEO子數(shù)據(jù)庫(kù)下載的表達(dá)數(shù)據(jù)

利用Cluster/Treeview軟件進(jìn)行聚類(lèi)分析

基因集共表達(dá)分析

14:00-17:00

交互作用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)可視化分析

利用Cytoscape軟件進(jìn)行關(guān)聯(lián)基因注釋及其交互關(guān)系、分子間相互作用及基因表達(dá)的可視化分析。

具體事宜:

1、培訓(xùn)期間提供午餐,晚餐自理。

2、上機(jī)實(shí)踐需自帶筆記本電腦,會(huì)場(chǎng)將布置充足的電源插座。請(qǐng)確保電腦配置無(wú)線網(wǎng)卡,操作系統(tǒng)為Win XP/ 7/ 8/ 10,而非Mac系統(tǒng)或上網(wǎng)本(個(gè)別軟件不能運(yùn)行)。

3、會(huì)場(chǎng)除正常無(wú)線wifi覆蓋外,將單獨(dú)鋪設(shè)網(wǎng)線以保證上網(wǎng)條件。盡管如此,為提高上網(wǎng)效率,建議學(xué)員自行攜帶4G無(wú)線上網(wǎng)卡。

4、授課幻燈PDF版、軟件(附帶安裝指南)及上機(jī)實(shí)踐文檔已上傳至百度網(wǎng)盤(pán),在報(bào)到通知中會(huì)告知登錄名及密碼。軟件請(qǐng)事先下載并安裝,如安裝有問(wèn)題,請(qǐng)咨詢客服或提前到達(dá)會(huì)場(chǎng)咨詢。

5、嚴(yán)格按照培訓(xùn)日程授課,最后一天(715日)下午仍有重要課程,外地學(xué)員需合理安排返程時(shí)間。

6、住宿統(tǒng)一安排在南京錦江都城酒店(南京南站店),主辦單位可為學(xué)員代訂房間,標(biāo)準(zhǔn)間單住380/人、合住190/人(含早餐),費(fèi)用自理;學(xué)員也可自行上網(wǎng)預(yù)訂。住宿費(fèi)發(fā)票在退房時(shí)由酒店開(kāi)具。對(duì)于需要合住的學(xué)員,會(huì)務(wù)組將按報(bào)到先后順序安排,最后出現(xiàn)單人無(wú)法安排的情況,需要自補(bǔ)房間差價(jià)。

會(huì)議費(fèi)用:

會(huì)議費(fèi)為615日前報(bào)名及交費(fèi)2800/人,615日后報(bào)名及交費(fèi)為3000/(5人團(tuán)體報(bào)名另優(yōu)惠400/)授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請(qǐng)函(蓋章)和發(fā)票。按繳費(fèi)先后順序確定座位號(hào)。

繳費(fèi)方式:

賬戶名稱:北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司 

賬戶號(hào):0200245009200091577

開(kāi)戶行:中國(guó)工商銀行北京豐益橋支行

匯款用途處寫(xiě)明:生物數(shù)據(jù)分析+姓名

或報(bào)到當(dāng)天現(xiàn)金(或刷卡)支付。

報(bào)名咨詢:

聯(lián)系人:章老師

手機(jī)號(hào):13121195178

E-mailHuasitai@263.net

如您或您的學(xué)生計(jì)劃參加請(qǐng)?zhí)顚?xiě)報(bào)名表并于報(bào)到前發(fā)送至聯(lián)系人E-mail。為確保您已報(bào)名成功,請(qǐng)之后來(lái)電或者發(fā)短信予以確認(rèn)。如有疑問(wèn),歡迎垂詢!

報(bào)名表

2018年5月25日